È un grandioso edificio barocco a croce latina. L’imponente facciata è scandita da colonne e ornata da sculture raffiguranti (da destra a sinistra): Santa Caterina d’Alessandria, San Zeno, Sant’Annone, Santa Barbara. Sopra il finestrone è posto lo stemma della Comunità: un leone rampante con due chiavi e tre gigli. La cupola dal disegno raffinato sovrasta la Basilica e le conferisce un armonioso slancio ascensionale: è un tipico esempio della produzione architettonica dell’architetto lonatese Paolo Soratini (1680-1762). L’interno comprende tredici altari, mentre l’altare maggiore è completato da una straordinaria pala conclusa nel 1752 dal pittore veronese Giambettino Cignaroli che raffigura La predica di San Giovanni Battista. Nella Sacrestia è conservato il trittico rinascimentale firmato da Bernardino Licinio e datato 1528.